Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RLFQ13129 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RLFQ13129 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RLFQ13129 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RLFQ13129 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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