Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FOXF1Q12946 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF1Q12946 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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