Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ST3GAL4Q11206 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ST3GAL4Q11206 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms