Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms