Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms