Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms