Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms