Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms