Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP2P81877 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms