Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IRX1P78414 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms