Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP7P55210 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP7P55210 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP7P55210 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms