Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms