Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2E1P29083 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms