Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTPRMP28827 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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