Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ITGB6P18564 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms