Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIF1CO43896 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIF1CO43896 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIF1CO43896 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KIF1CO43896 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIF1CO43896 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIF1CO43896 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIF1CO43896 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIF1CO43896 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KIF1CO43896 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KIF1CO43896 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms