Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms