Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCF2LO15068 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms