Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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DIRC3C9JPN6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
DIRC3C9JPN6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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