Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms