Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USH1CQ9Y6N9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms