Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q9Y3F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q9Y3F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms