Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2D4Q9Y2X8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2D4Q9Y2X8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms