Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED16Q9Y2X0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms