Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3LQ9Y262 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF3LQ9Y262 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF3LQ9Y262 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF3LQ9Y262 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF3LQ9Y262 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms