Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HHLA3Q9XRX5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms