Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms