Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms