Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP18Q9UMW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP18Q9UMW8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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