Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms