Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
INO80Q9ULG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
INO80Q9ULG1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
INO80Q9ULG1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms