Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms