Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SARDHQ9UL12 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARDHQ9UL12 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms