Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms