Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSR3Q9UJK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR3Q9UJK0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms