Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEFF2Q9UIK5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEFF2Q9UIK5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEFF2Q9UIK5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms