Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUF60Q9UHX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PUF60Q9UHX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PUF60Q9UHX1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms