Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED13Q9UHV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED13Q9UHV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED13Q9UHV7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms