Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEW3

MARCO, Macrophage receptor MARCO, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCOQ9UEW3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCOQ9UEW3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCOQ9UEW3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCOQ9UEW3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms