Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLIP2Q9UDT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP2Q9UDT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms