Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC17A7Q9P2U7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms