Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCOCO1Q9P1Z2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCOCO1Q9P1Z2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms