Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3BQ9P1U1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3BQ9P1U1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms