Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNKQ9P0W0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFNKQ9P0W0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNKQ9P0W0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms