Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms