Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD4Q9NZQ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMOD4Q9NZQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms