Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ING3Q9NXR8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ING3Q9NXR8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ING3Q9NXR8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ING3Q9NXR8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ING3Q9NXR8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ING3Q9NXR8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms