Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
THUMPD1Q9NXG2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms