Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNAU1APQ9NX07 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNAU1APQ9NX07 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms