Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf109Q9NX04 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf109Q9NX04 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms